پژوهشكده باقرالعلوم(ع)
- زمان و مكان و جريان ولادت
- نسب امام (پدرى و مادرى)
- اسماء، القاب، كنيه
- تصوير ظاهرى امام
- ازدواج، همسران
- فرزندان
- بستگان (عموها، برادران، خواهران، عموزادگان، برادرزادگان، خواهرزادگان)
- شهادت (زمان، مكان، قاتل، غسل، تكفين، نماز، تشييع، تدفين).
- محلّ دفن، تاريخچه حرم مطهر
- موقعيت ملّى، بين المللى
- موقعيت سياسى، اجتماعى
- موقعيت اقتصادى
- موقعيت سياسى، نظامى جهان معاصر مرتبط با امت اسلامى
- موقعيت سياسى، نظامى جهان متأثّر از امام
- موقعيت علمى و علوم در جهان معاصر
- حوزه علوم و عالمان اسلامى معاصر
- تمدن اسلامى در عصر امام
- حكومتها و خلفاى معاصر (موقعيت سياسى - نظامى)
- قيامها و نهضتهاى اصلاح طلبانه معاصر و پس از شهادت
- فرقههاى سياسى موجود، شكل گرفته و افول يافته در عصر امام و پس از شهادت (غلات، واقفيه، فطحيه، مجسّمه، زيديّه)
- مكتبهاى فكرى، عقيدتىِ موجود، شكلگرفته و افول يافته در عصر امام و پس از شهادت
- موقعيت سياسى، اجتماعى، اقتصادى، نظامى شيعيان در عصر امام (انقلابات، مناصب حكومتى، اماكن تحت نفوذ، عالمان، تأليفات،...)
زندگى شخصى، اجتماعى و فرهنگى امام (در كودكى و دوره امامت)
- اوصاف، مناقب و فضايل فردى (عبادى، اقتصادى،...)
- اوصاف، مناقب و فضايل خانوادگى (نسبت به والدين، همسران، فرزندان، نزديكان)
- اوصاف، مناقب و فضايل اجتماعى (نسبت به شيعيان، اهل كتاب،...)
- تحريفات زندگى امام
- فعاليتهاى فرهنگى، اجتماعى
- امامت و رهبرى و مسأله بلوغ
- دلايل عقلى و نقلى عصمتِ امام
- دلايل امامتِ امام (نصوص،...)
- شيوه كشف امامتِ امام توسط شيعيان
- معجزات و كرامات امام (كودكى، بزرگسالى)
- كرامات مرقد امام
- علم امام
- تأليفات امام
- حوزههاى علمى امام
- شاگردان امام
- حوزههاى علمى شاگردان امام
- تأليفات شاگردان امام
- فرق اسلامى و شخصيت علمى امام
- اهل كتاب و شخصيت علمى امام
- كفار و شخصيت علمى امام
- كلمات قصار
- نصايح و رهنمودها
- استفتائات
- مناظرات علمى
- مناجات (مناجات دهگانه سلسلةالذهب،...)
- نامهها و مكاتبات (با پدر،...)
- اماكن مقدسه و متبركه منسوب به امام
- امام و رهبرى سياسى شيعيان
- امام و مناصب سياسى، حكومتى
- امام و حكومتهاى معاصر اسلامى و غير اسلامى
- امام و خلفاى معاصر (مبارزه منفى، ارشاد، حرز)
- امام و اصحاب (اصحاب سرّ، نمايندگان و وكلاء، صحابه زن، كارگزاران،...)
- امام و مصالح امت اسلامى
- امام و سفرهاى سياسى
- امام و جلسات و همايشهاى سياسى
- امام و مناطق، گروهها و شخصيتهاى
سياسى (اسلامى، شيعى، غير اسلامى) (طرطوس، همدان، قم، كوفه،...)
- امام و توطئهها و تبليغات سوء (جاسوسان، منافقان،...)
- امام و سوء قصد به جان ايشان
- شهادت امام (كيفيت شهادت، عوامل مؤثر در شهادت، اثرات سياسى - اجتماعى شهادت)
- مقبره امام، كانون حركتها و تنشهاى سياسى
- سخنان معصومانِ قبل و بعد درباره امام
- سخنان امام درباره معصومان قبل و بعد - گفت و گوى امام با حضرت عبدالعظيمعليه السلام در مورد امام زمان(عج).
- تأثير و تأثّر از حركتهاى سياسى، فرهنگى، نظامى امامان قبل و بعد در رهبرى دينى و سياسى امام
- نامهها و مكاتبات امام با پدرش امام رضاعليه السلام
- شعر (ولادت، شخصيت، امامت و شهادت)
- مرثيه
- داستان
- امام و صحابه
- امام و تابعين
- امام و خلفاى صدر اسلام
- امام و درگيرىهاى سياسى، اجتماعى، نظامى صدر اسلام