5 - سبيل الرشاد در صرف و نحوو اصول و احكام و عبادات.
6 - خير الكلام فى المنطق و الكلام و اثبات امامه كل امام امام.
7 - رساله الاثنى عشريه در طهارت و نماز.
8 - فخر الشيعه در فضائل امير مومنان عليه السلام.
9 - الحق اليقين، كناب بزرگى است در منطق و كلام.
10 - سيف الشيعه، كه كتابى بزرگ در حديث است.
11 - سفينه النجاه فى فضائل الائمه الهداه عليهم السلام.
12 - البلاغ المبين در احاديث قدسيه.
13 - رساله دليل النجاح در دعا.
14 - ديوان شعر عربى و ديوان شعر ديگرى در فارسى.
15 - ايضا كتاب ديگرى در دعا.
16 - برهان الشيعه درامامت.
17 - حق اليقين در كلام.
18 - منطومه اى در نحو.
19 - رساله اى در نحو. نمونه اى از شعر سيد خلف را در مدح امير المومنين عليه السلام مى آوريم: - اى ابو الحسن، اى كسى كه در هنگامى كه حوادث ناگوار ما را احاطه مى كند، تو پناه پناهندگان هستى. - زيرا تو پاكترين مردم و نكوكارترين و والاترين مردمانى. - انسان مادام كه نميرد، و بهنگام مرگ نسبت و علاقه خود را بتو نرساند افتخارى كسب نكرده است.
سيد خلف مشعشعى در سال 1074 درگذشته است و شهاب حويزى او را مرثيه گفته، و رثايش در ديوان اشعارش موجود است. مطلع آن اينست. - يادگار نيكان و پيشوايى پاكان در گذشت، و سينه بزرگوارى، از اين پس از دل چنين بزگمردى خالى است.
سرورما، سيد محسن امين در اعيان الشيعه ج 37 - 20: 30، بطور مبسوط شرح حال او را آورده است.