در واقع بازسازي تفكّر اسلامي از ناحيه امام خميني (ره) در حوزه‌هاي مختلف نظري و عملي انجام شد كه به برخي از اين موارد اشاره مي‌شود:
چنانچه گذشت سكولاريسم تفكّر دنيايي كردن دين و يا به تعبيري جدايي دين از سياست است. حضرت امام خميني (ره) با دورانديشي خاص خود با اين تفكّر به مبارزه برخاست و تشكيل حكومت اسلامي از طرف ايشان، طليعه مبارزه با اين تز بود. ايشان از اول نهضت اسلامي تا زمان حياتشان با تكيه بر معارف اسلامي و سنّت نبوي و ائمه ـ عليهم السّلام ـ و تلاش‌هاي فراوان، توانست مجدداً دين را در عرصه اجتماع و سياست وارد كرده و پس از مدتي خمودي دين، آن را احيا نمايد.» ايشان در مباحث خويش بر اين نكته تأكيد مي‌كند كه شخص پيامبر ـ صلّي الله عليه و آله ـ با تأسيس چنين حكومتي (حكومت اسلامي) بر توزيع عدالت مديريت كرد و رياست امور نظامي را بر عهده گرفت. ضمن اين‌كه ضرورت استقرار چنين حكومتي به دوره پيامبر ـ صلّي الله عليه و آله ـ محدود نمي‌شد، زيرا اسلام به هر زمان و مكاني قابل تعميم است و اين باور مشترك همه مسلمانان است به علاوه، پيامبر ـ صلّي الله عليه و آله ـ رياست جامعه اسلامي را بعد از خودش به امام علي ـ عليه السّلام ـ سپرد تا همان راه را ادامه دهد و ايشان نيز به امامان بعد از خود سپرد.
[1] . صحيفه نور، ج 5، ص 215. [2] . همان، ج 7، ص 85. [3] . مجموعه مقالات كنگره بين‌المللي امام خميني و احياي تفكّر ديني، مقاله تجديد حيات انديشه ديني، خسروپناه، عليرضا، ج 2، ص 148. [4] . همان، ج 18، ص 120. [5] . صحيفه نور، ج 21، ص 91. [6] . وسائل‌الشيعه، 20 جلدي، ج 11، ص 37. [7] . همان، ص 36. [8] . امام خميني (ره) ولايت فقيه، نشر آثار، ص 53. [9] . اسلام ناب، نشر آثار، ص 449. [10] . امام خميني (ره) ولايت فقيه، نشر آثار ص 135. [11] . مجله حوزه، شماره 71 - 70، ص 215. [12] . همان، ص 218. [13] . ر.ك:مجموعه مقالات كنگره بين‌المللي امام خميني(ره)و احياي تفكّرديني،مقاله امام خميني و بازآفريني معرفت ديني، عاشورلنگرودي،حسن، ج3،ص323 .