بیشترلیست موضوعات شهيد مطهرى قدس سره، پرسشها و رسالت حوزويان ريشه يابى تاريخى پرسشها شيوه بر خورد استاد با پرسشگران 1. پرسشهاى مفيد و با ارزش 2. پرسشهاى فراتر از انديشه و خرد 3. در نظر گرفتن شرايط و استعداد پرسشگران 4. پرسش براى حقيقت جويى شايستگان پاسخ گويى به شبهه ها آگاهى از ديگر مكاتب و مذاهب آشنايى با دانشهاى روز پارسائى و انصاف توضیحاتافزودن یادداشت جدید
امروز و در عصر جديد وظيفه حوزه ها امروزى كردن پاسخها و هماهنگى آنها با زبان روز است.آگاهى ژرف استاد از سير تحول دانش و ريشه يابى مفاهيم اسلامى و نيز سرگذشت شبهه ها و پرسشهاى دينى او را توانا ساخت تا سرچشمه التقاط ها و تحريفها و دگرديسيها را در مفاهيم و فرهنگ اسلامى به جامعه نشان دهد و بستر تاريخى رويدادها را به درستى بنماياند.نمونه هاى زنده اى از ريشه يابى تاريخى مسائل و پرسشها و تحريفها را استاد در مباحث مربوط به تاريخ كربلا به بحث گذاشته و نيز در گفتاگوييهاى فقهى به تناسب تاريخچه بحثها و اصطلاحات را بررسى كرده و سرچشمه تاريخى شبهه ها را روشن ساخته است. در اين باره ايشان در بررسى فراز و نشيب خردگرايى در فقه و سرچشمه و انگيزه هاى پديد آمدن اخبارى گرى در روزگار صفويه نكته هاى نو و جالب ارائه كرده است.استاد شناسنامه انديشه هايى كه در حوزه دين فلسفه جامعه شناسى و... ابراز مى شد مى دانست كه ازكيست چه وقتى ارائه شد و چرا؟(چه بسيار كتابى در اطراف تاريخ اسلام و يا جامعه شناسى دين به دست استاد مى رسيد و ايشان پس از مطالعه مى گفت: اين فصل كتاب از كدام جامعه شناس امريكايى است و فلان بخش از فلان انديشه ور فرانسوى و اين سخن مربوط به دوره معاصر و آن نكته برخاسته از سده پيشين است.)(17)وى با ريشه يابى مسائل شبهه ها را از ريشه و بُن مى نماياند و اسلام خالص و ناب را از ناسره ها جدا مى كرد.توجه به اولويتها: استاد در پژوهشهاى علمى به دنبال اولويتها بود براى سرگرمى و تفنن و يا فضل فروشى و خودنمايى چيزى نمى نوشت و هر آنچه را مى دانست به زبان نمى آورد. او نيازها را در نظر مى گرفت كه چه كارى مهم