شيخ فضلاللّه بدون ترديد به لحاظ علمي سرآمد عالمان زمان خود بود. هيچكس در تهران و ديگر شهرهاي ايران به مقام علمي وي نميرسيد. در اينجا اظهارنظر بعضي از افراد معروف زمان وي را در مورد مقام علمي شيخ ميآوريم:شيخ فضلاللّه از لحاظ علم و آراستگي به كمال معروف و فقيه جامع و كامل مجتهد سرشناس و عالمي متبحّر از لحاظ اجتهاد برتر از ديگران بود.4اينكه مقام علمياش بالاتر از سيدين مسندنشين (آيتاللّه بهبهاني و آيتاللّه سيد محمد طباطبايي) است. مسايل شرعي غالباً به او رجوع ميشد.5در پايتخت مرجع امورات شرعي و تقريباً شخص اول ايران بود.6كسروي هم كه از سرسختترين مخالفين شيخ است معتقد است كه شيخ فضلاللّه مجتهد اعلم و باشكوه تهران شمرده ميشد.7در پايتخت، شيخ بالاترين مقام روحانيت را حائز بود. گفته ميشود از حيث معلومات و تبحر در معلومات دين از همگنانش برتري داشته و بسيار فهيم و باهوش بوده و در قدرت استدلال در ميان طبقؤ خود نظير نداشته است. هر روز در مساجد و درس و خانهاش هزاران نفر اجتماع ميكردند.8در بحبوحه انقلاب آنچه امكان داشت به اين پيرمرد به دروغ، افترأ و تهمت زدند. اما هيچكس منكر مقام علمي او نشد. شيخ فضلاللّه مقام اجتهاد داشت و اين مقام بر همهكس مسلم بود. به طوريكه حتي سرسختترين دشمنان او نيز نتوانستند عظمت علمي او را انكار كنند.9