اگر ممكن است در زمان مباهله مراعات روايات كند و آن روايت از ابوحمزه ثمالى از امام ابى جعفر باقر عليه السلام است فرمود: ساعتى كه در آن بايد مباهله كنى بين طلوع فجر تا طلوع آفتاب باشد.اما كيفيت مباهله در روايت محمد بن ابى عمير از محمد بن حكم از ابى مسروق از امام صادق عليه السلام آمده است گفت: عرضه داشتم ما با اهل سنت بحث مىكنيم و به گفتار خداى تعالى بر آنها احتجاج مىكنيم كه فرمود: اطيعوا الله و اطيعوا الرسول و اولى الامر منكم (105)خداى را اطاعت كنيد! و از پيامبر و ولايت امر پيروى نماييد! مىگويند اين آيه در مورد فرماندهان گردآنهارسيده است و با آنها احتجاج مىكنيم به قول خداى تعالى انما وليكم الله و رسوله و الذين آمنوا الذين يقيمون الصلاة و يوتون الزكوة و هم راكعون (106)ولى شما خدا وپيامبر و آنهايى كه ايمان آوردند مىباشند آنها كه نماز را بر پا مىدارند و در حالت ركوع زكات مىدهند. باتفاق مفسرين عامه و خاصه مراد از اين آيه حضرت على عليه السلام است.)ايشان مىگويند اين آيه در مورد مومنين نازل شده است. ما با ايشان به گفتار خداى تعالى كه فرمود: لا اسالكم عليه اجرا الا المودة فى القربى (107)(بگو من از شما اجر رسالت جز اين نخواهم كه مودت و محبت مرا در حق خويشاوندان منظور داريد(و دوستدار آل محمد باشيد كه اين اجر هم به نفع امت و براى هدايت يافتن آنهاست) احتجاج مىكنيم ايشان مىگويند: در اقرباى مسلمانان وارد شده است. پس هر چه در ياد من بود با حضرت بيان كردم وى به من فرمود: در اين صورت با ايشان مباهله كن! به حضرت عرضه داشتم: چگونه مباهله كنم؟ فرمود: سه روز خودت را اصلاح كن! گمان دارم كه فرمود: سه روز روزه بگير و توو و او به صحرا برويد! و انگشتان دست راست خود را با انگشت طرف چپ او شبكه نما و خودت شروع كن و بگو: اللهم رب السموات و رب الارضين السبع عالم الغيب و الشهاده الرحمن الرحيم ان كان مسروق جحد حقا وادعى باطلا فانزل عليه حسبانا من السماء او عذابا اليما.خدايا پروردگار آسمانها و زمينهاى هفت گانه! داناى نهان و آشكار! بخشنده مهربان! اگر ابى مسروق حقى را انكار كرده و يا باطلى را ادعا نموده بر وى صاعقه اى از آسمان يا عذابى دردناك بفرست.و بگو اگر فلانى ادعا حقى را انكار كرده، صاعقه اى از آسمان بر او بفرست! يا عذابى دردناك براى او در نظر بگير! تو آن عذاب را در او مىبينى ابى مسروق گفت: به خدا قسم! مردى را نيافتم كه مرا در آن اجابت كند.از ابن عباس روايت شده كه: انگشتان خود را در انگشتان او در هم فرو بر! و باز كن سپس بگو: اللهم ان كان فلانا جحد او اقربباطل فاصبه بحسبان من السماء او بعذاب اليم من عندك. خدايا اگر فلانى حقى را انكار كرد، يا باطلى را تثبيت نمود، صاعقه اى از آسمان يا عذابى دردناك بروى فرو فرست! و آنرا هفتاد بار تلاوت كن!