فكر خود باش مرحوم ملا محمد تقى مجلسى فرموده : من تشرف جستم به نماز خواندن بر جنازه او با جميع طلبه و فضلاء و بسيارى از مردم . وى در 12 شوال هزار و سى در اصفهان وفات يافت چنان كه بعضى در تاريخ او گفته است :افسر فضل اوفتاد و بى سر و پا گشت شرع جنازه اش را به ارض اقدس حمل كردند و در جوار روضه رضويه على ساكنها السلام والتحية در خانه آن جناب او را دفن كردند.مرحوم محدث قمى گويد: قريب به همين مضمون است وصيت مرحوم مير سيد شريف كه در حال احتضار فرزند او به وى گفت : بابا مرا وصيتى كن ! در پاسخ او فرمود: للّه للّه بابا به حال خود باش .پسر مضمون كلام بابا را به نظم آورده گفته است :
مرا مير شريف آن بحر زخحار
وصيت كرد و گفت هر گاه خواهى
چنان مستغرق اوقات خود باش
كه از حال كسى نايد ترا ياد(266)
كه رحمت بر روان پاك او باد
كه باشد در قيامت جان تو شاد
كه از حال كسى نايد ترا ياد(266)
كه از حال كسى نايد ترا ياد(266)