برقرار نشدن دوباره مجلس و مشروطيت به تحريم شيخ بسيارى از مشروطه خواهان و غربگرايان را ناخشنود ساخت از اين رو برخى روشنفكران سرسپرده كه ازمخالفتهاى شيخ خشمگين بودند و از سوى ديگر انتقام از دولت و درباريان غير ممكن بود با كمك سفارتخانه بريتانيا قصد قتل شيخ فضل الله در سفارت تهيه و توسط عامل آنها به دست ((كريم دواتگر)) از كميته مجازات (كه اعضاى اين كميته را اكثرا بهائيان و مشروطه خواهان افراطى تشكيل داده بودند) و ديگر همدستان او در شب 16 ذى الحجه 1326 ه ق به اجرا گذاشته شد حادثه هنگامى پيش آمد كه شيخ با فرزندش همراه دوستان از نماز شبانه به منزل بازمى گشت چند گلوله به سمت او شليك شد و از ناحيه پا زخمى گرديد و چون ضارب قصد خودكشى داشت وى را دستگير نمودند و در بازجوئى كه از او بعمل آمد اسامى افرادى به ميان آمد كه با سفارت انگليس در ارتباط بودند.كريم دواتگر ضارب شيخ فضل الله كه قاتل چند شخصيت ديگر نيز بود خود به دست همين كميته ترور شد.(334)